已知蛋白质序列和相应的mRNA序列,如何知道这段序列的基因比如在NCBI中,搜索基因:输入的是蛋白质序列NP_524925.1,那么就会找到这个蛋白对应的基因序列.但是如果是CAA67720.1这样的蛋白质序列,
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/02 19:34:21
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已知蛋白质序列和相应的mRNA序列,如何知道这段序列的基因
比如在NCBI中,搜索基因:输入的是蛋白质序列NP_524925.1,那么就会找到这个蛋白对应的基因序列.但是如果是CAA67720.1这样的蛋白质序列,如何找到这个蛋白质对应的基因序列?
请问,是需要用基因预测软件来预测还是有别的方法可用呢,因为我想知道这个蛋白质序列对应的核苷酸序列有几个外显子.
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最简单的办法:用BLAST工具
你不知是到蛋白质序列,在NCBI 用该蛋白质序列在BLAST数据库,进行blast,可以找出基因序列.
或将之转换为cDNA序列.
用cDNA去BLAST
都能找到你所想要的基因序列.
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